依據電解質的不同，燃料電池(FuelCell,FC)分為堿性燃料電池（AFC）、磷酸型燃料電池（pAFC）、熔融碳酸鹽燃料電池（MCFC）、固體氧化物燃料電池（SOFC）及質子交換膜燃料電池（pEMFC）等。其中屬于堿性燃料電池的只有AFC一種，而其余的燃料電池均屬于酸性燃料電池。可用于汽車的一般是pEMFC。

燃料電池的電極反應式與其電解質的酸堿性緊密聯系。

當電解質溶液接近中性時：

負極：2H2-4e=4H+正極：O2+4e+2H2O=4OH-

當電解質溶液呈酸性時：

負極：2H2-4e=4H+正極：O2+4e+4H+=2H2O

當電解質溶液呈堿性時：

負極：2H2-4e+4OH-=4H2O正極：O2+4e+2H2O=4OH-

注意所有的電子e都省略了負號上標，書寫時應當加上。燃料電池的排出物只有水，沒有二氧化碳等溫室氣體或氮氧化物等有毒氣體。因此說燃料電池汽車有著良好的環保性能。