第一階段是恒流充電，在鋰電池電壓低于4.2V時，充電器會以恒定電流充電。

第二階段是恒壓充電階段，當鋰電池電壓達到4.2V時，由于鋰電池特性，如果電壓再高，就會損壞，充電器會將電壓固定在4.2V,充電電流會逐步減小，當電流減小到一定值時(一般是1/10設置電流時)，切斷充電電路，充電完成指示燈亮，充電完成。

18650鋰電池充電器(3張)鋰離子電池過度充放電會對正負極造成永久性損壞。過度放電導致負極碳片層結構出現塌陷，而塌陷會造成充電過程中鋰離子無法插入;過度充電使過多的鋰離子嵌入負極碳結構，而造成其中部分鋰離子再也無法釋放出來。

18650鋰電池有些充電器使用廉價的方案實現的，在控制精度上不夠好，容易造成電池充電異常，甚至損壞電池。選購充電器的時候盡量選擇大品牌的18650鋰離子電池充電器，質量和售后有保證，延長鋰電池的使用壽命。

18650鋰離子電池充電器，品牌保障的比如Fenix智能18650充電器擁有四重保護：短路保護、過流保護、過壓保護、電池反接保護功能等。過充電保護：當充電器對鋰離子電池過充電時，為防止因溫度上升所導致的內壓上升，需終止充電狀態。為此，保護器件需監測電池電壓，當其到達電池過充電壓時，即激活過充電保護功能，中止充電。