磷酸亞鐵鋰離子電池也有其缺點:例如,低溫功能差,正極材料振動密度小,相同容量的磷酸亞鐵鋰離子電池體積大于鈷酸鋰等鋰離子電池,所以在微電池沒有優勢。當用于動力鋰電池時，磷酸鐵鋰離子電池與其他電池是相同的，要面對同樣的電池問題。

缺陷

一種材料是否具有開發潛力，除了重視其優點外，更重要的是這種材料是否有根本缺陷。

目前國內普遍選用磷酸鐵鋰作為動力鋰離子電池的正極材料，從政府、科研機構、公司甚至證券公司等市場分析人士都看好這種材料，將其作為動力鋰離子電池的開啟方向。分析其原因，重要有以下兩點:一是受美國研發方向的影響，其化合價和A123公司首先選擇做磷酸鐵鋰離子電池正極材料。其次，我國目前還沒有可用于動態鋰離子電池的錳酸鋰材料。但磷酸鐵鋰也有不可忽視的基本缺陷，總結如下:

1.在制備磷酸鐵鋰的燒結過程中，氧化鐵有可能在高溫回收氣氛中還原為單質鐵。簡單的鐵會造成電池的短路，是電池中最忌諱的材料。這就是為何日本沒有使用這種材料作為動態鋰離子電池的正極材料的第一個原因。

2.磷酸鐵鋰具有低振動密度、壓實密度等功能缺陷，導致鋰離子電池能量密度低。低溫功能差，即使是納米碳涂層也沒有解決這個問題。當阿貢國家實驗室儲能系統中心主任DonHillebrand博士談到磷酸鐵鋰離子電池的低溫功能時，他用了可怕的字眼。他們檢查了磷酸鐵鋰離子電池的結果，發現磷酸鐵鋰離子電池在低溫(0℃以下)下不能驅動電動汽車。盡管一些制造商聲稱鋰-鐵磷酸鹽電池在低溫下仍能很好地保持其容量，但此時的放電電流較低，放電截止電壓也較低。在這種情況下，設備根本無法啟動作業。

3.材料制備成本高于電池制造成本，電池成品率較低。磷酸鐵鋰的納米化和碳包覆雖然提高了材料的電化學性能，但也帶來了能量密度降低、成本提高、電極加工質量差、環境要求等問題。磷酸鐵鋰中鋰、鐵、磷等化學元素含量豐富，成本低，但制備磷酸鐵鋰的產品成本不低。即使去掉前期的開發成本，材料的技術成本再加上電池制備的較高成本，單位儲能的成本終究還是很高的。

4.產品同質性的差異。目前我國還沒有一家磷酸鐵鋰材料廠可以解決這個問題。從材料制備的角度看，磷酸鐵鋰的組成是一個混亂的多相反應，由固體磷酸鹽、氧化鐵和鋰、碳前驅體和回收氣相組成。在這個混亂的過程中，很難保證反應的均勻性。

5.知識產權的問題。目前磷酸鐵鋰的基礎專利由德克薩斯大學持有，碳涂層專利由加拿大人申請。這兩項基礎專利是不能繞過的，假如把專利的使用成本算進去，產品的成本會進一步提高。

此外，從研發和生產鋰離子電池的相關經驗來看，日本是第一個將鋰離子電池商業化的國家，并一直占據高端鋰離子電池市場。盡管美國進行了各種先發制人的研究，但迄今為止仍未能生產出一種重要的鋰離子電池。因此，日本選擇改性錳酸鋰作為動力鋰離子電池的負極材料更為合理。甚至在美國，制造鋰磷酸鐵和錳酸鋰作為鋰離子電池的負極材料