成本

成本高、制氫過程復雜成為燃料動力電池發展的重要障礙。氫氣通過電解或蒸汽重組的方法得到。不過這兩種方法成本頗高，制造同樣質量的天然氣所需的成本為制氫的1/2甚至1/3。

鋰離子電池生產成本相對較低，此外其重復充電利用非常方便，相比其他可攜帶能源，其具有更高的成本效益。

環境影響

燃料動力電池和鋰離子電池對環境的影響都很小。前者燃燒產物為水，不會出現汽油/柴油燃燒后生成的溫室氣體。

鋰離子電池的放電產物可能由氧化鋰、氫氧化鋰等，對環境也不會造成影響。此外，鋰離子電池可重復利用。

潛力

無論燃料動力電池還是鋰離子電池，相關的技術均還有大量進步的空間。假如燃料動力電池的成本能夠降低，則能夠真正作為汽油/柴油燃料的替代能源。

關于鋰離子電池來說，假如其能量密度能夠進一步提高，循環壽命能夠更長，則也是一種非常優秀的驅動能源。

挑戰

關于燃料動力電池來說，還有多項技術難題等待解決。例如，鉑催化劑的高成本、密封技術的復雜工藝、體積龐大的儲氫罐以及啟動時間較長等問題。