有一種專門配合鋰電使用的控制器，改鋰電后換鋰電池專用的控制器會更好一些。其實鋰電控制器與鉛酸電池控制器原理都是一樣的，硬件也都是一樣的，唯獨欠壓值不一樣。鋰電專用控制器欠壓值要低于鉛酸電池。電池利用率更高一些。

以48v鉛酸控制器為例，欠壓保護值約在411伏左右，電瓶電壓下降到41V左右時雖然車輛仍然可以低速行駛，但是此時電瓶已經處在深放電過放電狀態，壽命會大大縮短。而控制器的欠壓保護功能則有效地避免了電池過放電。

鋰電吃控制器也是一樣的原理，以48V13串的鋰電池為例，滿電54.6V，最低放電電壓37.8V。所以用上鉛酸電池控制器后，電池下降到41v左右的時候控制器進入欠壓保護狀態，鋰電的電量并沒有全部釋放出來，會降低續航里程。

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